自鸣钟作为庄园的圣器首次被发现与神秘事件相关联。玩家在完成前期任务时会遇到三个分布在不同地图的黄色光圈，分别位于摩尔拉雅雪山的滑雪跑道缆车侧、前哨站右侧黄色土地以及阳光牧场梅森旁的小河边。这些光圈是触发自鸣钟剧情的关键线索，通过与NPC对话和自动寻路功能可逐步推进任务。
调查过程中，玩家会从艾尔警官处获得RK留下的密码表和字条，通过解谜发现自鸣钟被偷窃的事实。密码表采用符号与数字对应的形式，需要玩家结合场景中的线索进行破译。自鸣钟失窃导致庄园居民陷入异常倦怠状态，这种剧情设定暗示了该物品具有影响时间流动的特殊能力。
后续追踪显示，自鸣钟被盗与新角色布偶鸟直接相关。这种由神秘人操控的双头布偶鸟会使用魔法力量，玩家需通过解救被绑架的拉姆狗仔等任务，逐步揭露布偶鸟与RK之间的关联。游戏在此环节设计了假布偶交换的战术玩法，要求玩家与NPC艾尔、瑞琪团长合作制定计划。
最终自鸣钟的找回揭示了更深层的世界观设定。根据茜茜的占卜和玩家获得的预言提示，自鸣钟属于七大圣器之一，其力量与封印魔王的历史直接相关。游戏通过金色种子的发芽等细节，暗示后续剧情将围绕圣器与黑魔法的对抗展开。该段剧情为玩家理解摩尔庄园的魔法体系奠定了基础。
